Precursor miRCarta

ssc-59.1

Accession ssc-59.1
similar to following miRBase precursors ssc-mir-192 (MI0013127)
Organism Sus scrofa
Genome Sscrofa11.1
Location Chr2:7,285,677-7,285,746 (+)
miRNA m-59
Sequence (5' -> 3')
(70 nts)
CUGACCUAUGAAUUGACAGCCAGUGCUCUCAUCUCCCCUCUGGCUGCCAAUUCCAUAGGUCACAGGUAUG
MFE -29.60 kcal/mol
first miRCarta version 1.0
last miRCarta version 1.1
Clusters (10 kb)
(2 precursors)
ssc-126.1
ssc-59.1

Predicted Structure

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:1empty:1Cempty:1empty:2empty:2Gempty:2empty:3empty:3Aempty:3empty:4empty:4Gempty:4empty:5empty:5Uempty:5empty:6empty:6Gempty:6empty:7empty:7Cempty:7empty:8empty:8Aempty:8empty:9empty:9Cempty:9empty:10empty:10Aempty:10empty:11empty:11Gempty:11empty:12empty:12Gempty:12empty:13empty:13Gempty:13empty:14empty:14Cempty:14empty:15empty:15Uempty:15m-59empty:16Cm-59m-59empty:17Um-59m-59empty:18Gm-59m-59empty:19Am-59m-59empty:20Cm-59m-59empty:21Cm-59m-59empty:22Um-59m-59empty:23Am-59m-59empty:24Um-59m-59empty:25Gm-59m-59empty:26Am-59m-59empty:27Am-59m-59empty:28Um-59m-59empty:29Um-59m-59empty:30Gm-59m-59empty:31Am-59m-59empty:32Cm-59m-59empty:33Am-59m-59empty:34Gm-59m-59empty:35Cm-59m-59empty:36Cm-59empty:37empty:37Aempty:37empty:38empty:38Gempty:38empty:39empty:39Uempty:39empty:40empty:40Gempty:40empty:41empty:41Cempty:41empty:42empty:42Uempty:42empty:43empty:43Cempty:43empty:44empty:44Uempty:44empty:45empty:45Cempty:45empty:46empty:46Aempty:46empty:47empty:47Uempty:47empty:48empty:48Cempty:48empty:49empty:49Uempty:49empty:50empty:50Cempty:50empty:51empty:51Cempty:51empty:52empty:52Cempty:52empty:53empty:53Cempty:53empty:54empty:54Uempty:54empty:55empty:55Cempty:55empty:56empty:56Uempty:56empty:57empty:57Gempty:57empty:58empty:58Gempty:58empty:59empty:59Cempty:59empty:60empty:60Uempty:60empty:61empty:61Gempty:61empty:62empty:62Cempty:62empty:63empty:63Cempty:63empty:64empty:64Aempty:64empty:65empty:65Aempty:65empty:66empty:66Uempty:66empty:67empty:67Uempty:67empty:68empty:68Cempty:68empty:69empty:69Cempty:69empty:70empty:70Aempty:70empty:71empty:71Uempty:71empty:72empty:72Aempty:72empty:73empty:73Gempty:73empty:74empty:74Gempty:74empty:75empty:75Uempty:75empty:76empty:76Cempty:76empty:77empty:77Aempty:77empty:78empty:78Cempty:78empty:79empty:79Aempty:79empty:80empty:80Gempty:80empty:81empty:81Gempty:81empty:82empty:82Uempty:82empty:83empty:83Aempty:83empty:84empty:84Uempty:84empty:85empty:85Gempty:851020304050607080

Genomic context

Gene legend:
This website uses Matomo Analytics and cookies. For more information, please refer to the privacy notice for our websites. Learn moreI agree