Precursor miRCarta

ptr-1725.1

Accession ptr-1725.1
similar to following miRBase precursors ptr-mir-300 (MI0008596)
Organism Pan troglodytes
Genome Pan_tro 3.0
Location chr14:86,289,611-86,289,682 (+)
miRNA m-1725
Sequence (5' -> 3')
(72 nts)
GCUACUUGAAGAGAGGUAAUCCUUCAUGCAUUUGCUUUACUUGCAAUGAUUAUACAAGGGCAGACUCUCUCU
MFE -14.70 kcal/mol
first miRCarta version 1.0
last miRCarta version 1.1
Clusters (10 kb)
(16 precursors)
ptr-31114.1
ptr-356.1
ptr-384.1
ptr-469.1
ptr-230.1
ptr-636.1
ptr-469.2
ptr-1725.1
ptr-927.1
ptr-927.2
ptr-161.1
ptr-383.1
ptr-433.1
ptr-285.1
ptr-935.1
ptr-532.1

Predicted Structure

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:1empty:1Gempty:1empty:2empty:2Cempty:2empty:3empty:3Uempty:3empty:4empty:4Aempty:4empty:5empty:5Cempty:5empty:6empty:6Uempty:6empty:7empty:7Uempty:7empty:8empty:8Gempty:8empty:9empty:9Aempty:9empty:10empty:10Aempty:10empty:11empty:11Gempty:11empty:12empty:12Aempty:12empty:13empty:13Gempty:13empty:14empty:14Aempty:14empty:15empty:15Gempty:15empty:16empty:16Gempty:16empty:17empty:17Uempty:17empty:18empty:18Aempty:18empty:19empty:19Aempty:19empty:20empty:20Uempty:20empty:21empty:21Cempty:21empty:22empty:22Cempty:22empty:23empty:23Uempty:23empty:24empty:24Uempty:24empty:25empty:25Cempty:25empty:26empty:26Aempty:26empty:27empty:27Uempty:27empty:28empty:28Gempty:28empty:29empty:29Cempty:29empty:30empty:30Aempty:30empty:31empty:31Uempty:31empty:32empty:32Uempty:32empty:33empty:33Uempty:33empty:34empty:34Gempty:34empty:35empty:35Cempty:35empty:36empty:36Uempty:36empty:37empty:37Uempty:37empty:38empty:38Uempty:38empty:39empty:39Aempty:39empty:40empty:40Cempty:40empty:41empty:41Uempty:41empty:42empty:42Uempty:42empty:43empty:43Gempty:43empty:44empty:44Cempty:44empty:45empty:45Aempty:45empty:46empty:46Aempty:46empty:47empty:47Uempty:47empty:48empty:48Gempty:48empty:49empty:49Aempty:49empty:50empty:50Uempty:50m-1725empty:51Um-1725m-1725empty:52Am-1725m-1725empty:53Um-1725m-1725empty:54Am-1725m-1725empty:55Cm-1725m-1725empty:56Am-1725m-1725empty:57Am-1725m-1725empty:58Gm-1725m-1725empty:59Gm-1725m-1725empty:60Gm-1725m-1725empty:61Cm-1725m-1725empty:62Am-1725m-1725empty:63Gm-1725m-1725empty:64Am-1725m-1725empty:65Cm-1725m-1725empty:66Um-1725m-1725empty:67Cm-1725m-1725empty:68Um-1725m-1725empty:69Cm-1725m-1725empty:70Um-1725m-1725empty:71Cm-1725m-1725empty:72Um-1725empty:73empty:73Gempty:73empty:74empty:74Gempty:74empty:75empty:75Gempty:75empty:76empty:76Gempty:76empty:77empty:77Aempty:77empty:78empty:78Gempty:78empty:79empty:79Cempty:79empty:80empty:80Aempty:80empty:81empty:81Aempty:81empty:82empty:82Aempty:82empty:83empty:83Uempty:83empty:84empty:84Cempty:84empty:85empty:85Cempty:85empty:86empty:86Uempty:86empty:87empty:87Gempty:871020304050607080

Genomic context

GCF_000001515.7_Pan_tro_3.0 chr14:86,279,611-86,299,69786,280,00086,282,00086,284,00086,286,00086,288,00086,290,00086,292,00086,294,00086,296,00086,298,000
Gene legend:
lncRNA
miRNA
miRCarta_miRNA
This website uses Matomo Analytics and cookies. For more information, please refer to the privacy notice for our websites. Learn moreI agree