Precursor miRCarta

ccr-27.1

Accession ccr-27.1
similar to following miRBase precursors ccr-mir-100 (MI0023303)
Organism Cyprinus carpio
Genome common carp genome
Location 29:5,701,351-5,701,436 (+)
miRNA m-27
Sequence (5' -> 3')
(86 nts)
CCUGCCUGCUGACACAAACCCGUAGAUCCGAACUUGUGGUGACUGUCCACACAAGCUUGUAUCUAUAGGUAUCUGUCUGUGUGGCA
MFE -30.70 kcal/mol
first miRCarta version 1.0
last miRCarta version 1.1
Clusters (10 kb)
(1 precursors)
ccr-27.1

Predicted Structure

30bdebfc-8bbd-4e36-aab0-9208d13a93887d970ba4-8070-49f1-973c-f99c43e6ce6892fa4343-082e-4ae8-a258-09ca8be762f2c3160ab0-7bf6-41dc-ac40-00c10a1b92e27d970ba4-8070-49f1-973c-f99c43e6ce6892fa4343-082e-4ae8-a258-09ca8be762f22a7baa7e-a2e9-46ae-95fb-906a002d0184a4bd3f06-99b8-427b-85e3-565470ec002f92fa4343-082e-4ae8-a258-09ca8be762f22a7baa7e-a2e9-46ae-95fb-906a002d0184bcfd4f97-2fa7-46e6-8868-ecf272273c37f2b27401-70b8-47d9-8bb8-7978727d44632a7baa7e-a2e9-46ae-95fb-906a002d0184bcfd4f97-2fa7-46e6-8868-ecf272273c378ffd62bb-7694-45c8-b8f1-8701fb79faf42e1e221b-37f6-4fc3-a4c8-6f90128114f4bcfd4f97-2fa7-46e6-8868-ecf272273c378ffd62bb-7694-45c8-b8f1-8701fb79faf46ec34161-b1bf-4299-8882-6b06b041e148a38081f6-6519-4319-afb3-f63ac4b5dc3d8ffd62bb-7694-45c8-b8f1-8701fb79faf46ec34161-b1bf-4299-8882-6b06b041e1487b096b7a-b734-430a-9521-f1eb71828a47e185c336-82dc-4a51-9e65-5aab48a7ca336ec34161-b1bf-4299-8882-6b06b041e1487b096b7a-b734-430a-9521-f1eb71828a474466a3d0-110f-4c7a-9d89-dd612a97e5fd86f34f63-1b3e-4b91-90f9-dc2ed2f761d37b096b7a-b734-430a-9521-f1eb71828a474466a3d0-110f-4c7a-9d89-dd612a97e5fd4466a3d0-110f-4c7a-9d89-dd612a97e5fdc90ed09f-cecb-4ca9-a1a3-3a0e40c0ec94d2083b0b-80ef-48a6-a6b0-c05cb0486b986fc9af79-dda5-4dc9-98e8-5fa1218f4c30c90ed09f-cecb-4ca9-a1a3-3a0e40c0ec94d2083b0b-80ef-48a6-a6b0-c05cb0486b98d19c863d-a13e-44b5-95ed-a4fb7be399ec9039b659-2db1-4808-bc10-a420097c290cd2083b0b-80ef-48a6-a6b0-c05cb0486b98d19c863d-a13e-44b5-95ed-a4fb7be399ec706f7f39-1fff-4f0a-85e6-19605c7fcdb560d50704-2578-4109-a9a2-372d50f86f74d19c863d-a13e-44b5-95ed-a4fb7be399ec706f7f39-1fff-4f0a-85e6-19605c7fcdb5fdb98590-0dee-43a7-a453-a096ebbd1798e1528281-e5e3-4043-8f68-b30d49d6ecd9706f7f39-1fff-4f0a-85e6-19605c7fcdb5fdb98590-0dee-43a7-a453-a096ebbd1798fdb98590-0dee-43a7-a453-a096ebbd179870b3fec1-b347-4fe6-9dbf-b160a6912a0370b3fec1-b347-4fe6-9dbf-b160a6912a03085ad281-394a-4637-b0ab-489109a38f3b085ad281-394a-4637-b0ab-489109a38f3bf2a5da79-90b8-4509-8518-d41ad17ef896a698dfd8-14f4-482b-b074-729e6d2737659a5568fc-59d6-49aa-a08f-26e66ed05a9df2a5da79-90b8-4509-8518-d41ad17ef896a698dfd8-14f4-482b-b074-729e6d2737657cf080aa-c253-4191-ac7d-db636569e37ea1285282-e349-465c-8138-ab6d527841dda698dfd8-14f4-482b-b074-729e6d2737657cf080aa-c253-4191-ac7d-db636569e37e8e36946f-1676-41d5-9242-87b2f3bb4611affd4ece-b89a-4e95-ab80-bc0e1077d3b67cf080aa-c253-4191-ac7d-db636569e37e8e36946f-1676-41d5-9242-87b2f3bb46118e36946f-1676-41d5-9242-87b2f3bb46114cc56fdf-10c8-42ba-8290-50435ea7db20d64e50da-5767-4a1e-9d83-f88bcef72c2418a0bc51-bff6-4ca2-ab55-ea8db96fe1dc4cc56fdf-10c8-42ba-8290-50435ea7db20d64e50da-5767-4a1e-9d83-f88bcef72c24b868e8d6-296a-4460-8bdf-616a1b16448974e73291-6f5f-4dee-8545-208d76937be0d64e50da-5767-4a1e-9d83-f88bcef72c24b868e8d6-296a-4460-8bdf-616a1b164489c55debbe-f13a-4111-878c-9148aa3a96f3e3710477-35ca-4de3-bf75-0277428070ebb868e8d6-296a-4460-8bdf-616a1b164489c55debbe-f13a-4111-878c-9148aa3a96f3133ee73e-33ce-49a6-a62f-d99cc653614d4b17019d-a03f-41b6-bd7d-3f49906ebf28c55debbe-f13a-4111-878c-9148aa3a96f3133ee73e-33ce-49a6-a62f-d99cc653614d2f51aa75-b466-4b1e-8e1a-57d0fbc91b6e9bda1af2-4875-4032-ac42-2c1606d8704c133ee73e-33ce-49a6-a62f-d99cc653614d2f51aa75-b466-4b1e-8e1a-57d0fbc91b6e5e4b4895-75d7-4a85-b76b-cd6e22705aee61158246-2ca4-416f-bae0-90cb8fdbb0482f51aa75-b466-4b1e-8e1a-57d0fbc91b6e5e4b4895-75d7-4a85-b76b-cd6e22705aee5e4b4895-75d7-4a85-b76b-cd6e22705aee12a0b9f0-ac6c-491b-b9bd-84f49362300be1303f46-bda2-4344-9a4d-053158b49d30369c0fd4-574a-402d-8d06-cc8a67f4234b12a0b9f0-ac6c-491b-b9bd-84f49362300be1303f46-bda2-4344-9a4d-053158b49d30aa175c13-954e-40fb-90f6-e7082044b3802fed3ef5-9c4d-4ad9-9e82-40ec67c2da46e1303f46-bda2-4344-9a4d-053158b49d30aa175c13-954e-40fb-90f6-e7082044b3802a85745e-8d29-464b-96d8-de58c82623fcd09942d5-fe40-43ab-984c-9d094b82ab7aaa175c13-954e-40fb-90f6-e7082044b3802a85745e-8d29-464b-96d8-de58c82623fc2a85745e-8d29-464b-96d8-de58c82623fc689308a3-7571-43a9-818f-aadd425faa1b60e0478d-1760-4fa6-96c9-a18c46772fea94451852-f488-4293-8ea2-1beb0dd7f529689308a3-7571-43a9-818f-aadd425faa1b60e0478d-1760-4fa6-96c9-a18c46772feae5e485da-8e48-48ff-913b-2f5e174e830c21714517-905b-413a-943a-ef3e2593f57f60e0478d-1760-4fa6-96c9-a18c46772feae5e485da-8e48-48ff-913b-2f5e174e830c96c26499-ba3f-4219-a3e1-ba6fc57f7d74c1a1b1e6-dde3-480a-8d61-11914b2fbfc3e5e485da-8e48-48ff-913b-2f5e174e830c96c26499-ba3f-4219-a3e1-ba6fc57f7d7432b4eec8-850f-44ca-8047-a24a85f7004be4149356-55de-4239-a6e8-ea9f9db6d45196c26499-ba3f-4219-a3e1-ba6fc57f7d7432b4eec8-850f-44ca-8047-a24a85f7004bb37ba96f-4909-4efc-97c8-7d72f49944aff80d9379-6722-4111-9857-66d415d11e4332b4eec8-850f-44ca-8047-a24a85f7004bb37ba96f-4909-4efc-97c8-7d72f49944af283e915e-80c9-485d-ac51-f89bbb9754ad93e71ff6-2d2e-4520-aa77-a2b7ceb621afb37ba96f-4909-4efc-97c8-7d72f49944af283e915e-80c9-485d-ac51-f89bbb9754ad283e915e-80c9-485d-ac51-f89bbb9754ad4e762f5e-7ddd-494a-97fb-a32c0bac0667ca3d50d0-54ec-46c5-9208-8919ae170aede88f8616-b79d-4b20-9383-606f1f0e920e4e762f5e-7ddd-494a-97fb-a32c0bac0667ca3d50d0-54ec-46c5-9208-8919ae170aed93a52701-cb8f-4b78-97b1-c4a580954bf0cd7243f9-83d8-4b41-a1c8-112debf04db4ca3d50d0-54ec-46c5-9208-8919ae170aed93a52701-cb8f-4b78-97b1-c4a580954bf093a52701-cb8f-4b78-97b1-c4a580954bf06adb9949-a1e9-4e66-b768-33419ed817ba6adb9949-a1e9-4e66-b768-33419ed817ba2f55dd79-9ec4-45b8-82f9-f854358c18562f55dd79-9ec4-45b8-82f9-f854358c18565cb420be-2e3a-4336-b6bd-c3dfe3e776305cb420be-2e3a-4336-b6bd-c3dfe3e77630c8341d1f-551d-47cc-9141-d694df038188c8341d1f-551d-47cc-9141-d694df0381889db79644-c811-4feb-9bf4-6afcdee1eff79db79644-c811-4feb-9bf4-6afcdee1eff772914d28-5bb2-47cd-96e8-e965c27f903acd7243f9-83d8-4b41-a1c8-112debf04db493a52701-cb8f-4b78-97b1-c4a580954bf072914d28-5bb2-47cd-96e8-e965c27f903acd7243f9-83d8-4b41-a1c8-112debf04db4e88f8616-b79d-4b20-9383-606f1f0e920eca3d50d0-54ec-46c5-9208-8919ae170aedcd7243f9-83d8-4b41-a1c8-112debf04db4e88f8616-b79d-4b20-9383-606f1f0e920e93e71ff6-2d2e-4520-aa77-a2b7ceb621af283e915e-80c9-485d-ac51-f89bbb9754ade88f8616-b79d-4b20-9383-606f1f0e920e93e71ff6-2d2e-4520-aa77-a2b7ceb621aff80d9379-6722-4111-9857-66d415d11e43b37ba96f-4909-4efc-97c8-7d72f49944af93e71ff6-2d2e-4520-aa77-a2b7ceb621aff80d9379-6722-4111-9857-66d415d11e43e4149356-55de-4239-a6e8-ea9f9db6d45132b4eec8-850f-44ca-8047-a24a85f7004bf80d9379-6722-4111-9857-66d415d11e43e4149356-55de-4239-a6e8-ea9f9db6d451c1a1b1e6-dde3-480a-8d61-11914b2fbfc396c26499-ba3f-4219-a3e1-ba6fc57f7d74e4149356-55de-4239-a6e8-ea9f9db6d451c1a1b1e6-dde3-480a-8d61-11914b2fbfc321714517-905b-413a-943a-ef3e2593f57fe5e485da-8e48-48ff-913b-2f5e174e830cc1a1b1e6-dde3-480a-8d61-11914b2fbfc321714517-905b-413a-943a-ef3e2593f57f94451852-f488-4293-8ea2-1beb0dd7f52960e0478d-1760-4fa6-96c9-a18c46772fea21714517-905b-413a-943a-ef3e2593f57f94451852-f488-4293-8ea2-1beb0dd7f52994451852-f488-4293-8ea2-1beb0dd7f5297d53c43f-e502-4ead-97ae-01470a01e5a7d09942d5-fe40-43ab-984c-9d094b82ab7a2a85745e-8d29-464b-96d8-de58c82623fc7d53c43f-e502-4ead-97ae-01470a01e5a7d09942d5-fe40-43ab-984c-9d094b82ab7a2fed3ef5-9c4d-4ad9-9e82-40ec67c2da46aa175c13-954e-40fb-90f6-e7082044b380d09942d5-fe40-43ab-984c-9d094b82ab7a2fed3ef5-9c4d-4ad9-9e82-40ec67c2da46369c0fd4-574a-402d-8d06-cc8a67f4234be1303f46-bda2-4344-9a4d-053158b49d302fed3ef5-9c4d-4ad9-9e82-40ec67c2da46369c0fd4-574a-402d-8d06-cc8a67f4234b369c0fd4-574a-402d-8d06-cc8a67f4234b0341b0ef-cf46-4902-8dd6-50bca452001e61158246-2ca4-416f-bae0-90cb8fdbb0485e4b4895-75d7-4a85-b76b-cd6e22705aee0341b0ef-cf46-4902-8dd6-50bca452001e61158246-2ca4-416f-bae0-90cb8fdbb0489bda1af2-4875-4032-ac42-2c1606d8704c2f51aa75-b466-4b1e-8e1a-57d0fbc91b6e61158246-2ca4-416f-bae0-90cb8fdbb0489bda1af2-4875-4032-ac42-2c1606d8704c4b17019d-a03f-41b6-bd7d-3f49906ebf28133ee73e-33ce-49a6-a62f-d99cc653614d9bda1af2-4875-4032-ac42-2c1606d8704c4b17019d-a03f-41b6-bd7d-3f49906ebf28e3710477-35ca-4de3-bf75-0277428070ebc55debbe-f13a-4111-878c-9148aa3a96f34b17019d-a03f-41b6-bd7d-3f49906ebf28e3710477-35ca-4de3-bf75-0277428070eb74e73291-6f5f-4dee-8545-208d76937be0b868e8d6-296a-4460-8bdf-616a1b164489e3710477-35ca-4de3-bf75-0277428070eb74e73291-6f5f-4dee-8545-208d76937be018a0bc51-bff6-4ca2-ab55-ea8db96fe1dcd64e50da-5767-4a1e-9d83-f88bcef72c2474e73291-6f5f-4dee-8545-208d76937be018a0bc51-bff6-4ca2-ab55-ea8db96fe1dc18a0bc51-bff6-4ca2-ab55-ea8db96fe1dcbc755bce-4a5e-4145-9763-71cfcaaf56dbaffd4ece-b89a-4e95-ab80-bc0e1077d3b68e36946f-1676-41d5-9242-87b2f3bb4611bc755bce-4a5e-4145-9763-71cfcaaf56dbaffd4ece-b89a-4e95-ab80-bc0e1077d3b6a1285282-e349-465c-8138-ab6d527841dd7cf080aa-c253-4191-ac7d-db636569e37eaffd4ece-b89a-4e95-ab80-bc0e1077d3b6a1285282-e349-465c-8138-ab6d527841dd9a5568fc-59d6-49aa-a08f-26e66ed05a9da698dfd8-14f4-482b-b074-729e6d273765a1285282-e349-465c-8138-ab6d527841dd9a5568fc-59d6-49aa-a08f-26e66ed05a9d9a5568fc-59d6-49aa-a08f-26e66ed05a9d1e340c73-9f6d-4619-9a00-48408d8145761e340c73-9f6d-4619-9a00-48408d814576d0e4fe5e-08ad-4ad0-8452-787062443c4bd0e4fe5e-08ad-4ad0-8452-787062443c4bea767566-9b50-42b0-90ec-20431622c0d9e1528281-e5e3-4043-8f68-b30d49d6ecd9fdb98590-0dee-43a7-a453-a096ebbd1798ea767566-9b50-42b0-90ec-20431622c0d9e1528281-e5e3-4043-8f68-b30d49d6ecd960d50704-2578-4109-a9a2-372d50f86f74706f7f39-1fff-4f0a-85e6-19605c7fcdb5e1528281-e5e3-4043-8f68-b30d49d6ecd960d50704-2578-4109-a9a2-372d50f86f749039b659-2db1-4808-bc10-a420097c290cd19c863d-a13e-44b5-95ed-a4fb7be399ec60d50704-2578-4109-a9a2-372d50f86f749039b659-2db1-4808-bc10-a420097c290c6fc9af79-dda5-4dc9-98e8-5fa1218f4c30d2083b0b-80ef-48a6-a6b0-c05cb0486b989039b659-2db1-4808-bc10-a420097c290c6fc9af79-dda5-4dc9-98e8-5fa1218f4c306fc9af79-dda5-4dc9-98e8-5fa1218f4c306cad2a17-ea3e-4c4d-9d46-f99ea9d1c52586f34f63-1b3e-4b91-90f9-dc2ed2f761d34466a3d0-110f-4c7a-9d89-dd612a97e5fd6cad2a17-ea3e-4c4d-9d46-f99ea9d1c52586f34f63-1b3e-4b91-90f9-dc2ed2f761d3e185c336-82dc-4a51-9e65-5aab48a7ca337b096b7a-b734-430a-9521-f1eb71828a4786f34f63-1b3e-4b91-90f9-dc2ed2f761d3e185c336-82dc-4a51-9e65-5aab48a7ca33a38081f6-6519-4319-afb3-f63ac4b5dc3d6ec34161-b1bf-4299-8882-6b06b041e148e185c336-82dc-4a51-9e65-5aab48a7ca33a38081f6-6519-4319-afb3-f63ac4b5dc3da38081f6-6519-4319-afb3-f63ac4b5dc3d6c8f9fba-7126-4814-be78-377d3bd1fe402e1e221b-37f6-4fc3-a4c8-6f90128114f48ffd62bb-7694-45c8-b8f1-8701fb79faf46c8f9fba-7126-4814-be78-377d3bd1fe402e1e221b-37f6-4fc3-a4c8-6f90128114f4f2b27401-70b8-47d9-8bb8-7978727d4463bcfd4f97-2fa7-46e6-8868-ecf272273c372e1e221b-37f6-4fc3-a4c8-6f90128114f4f2b27401-70b8-47d9-8bb8-7978727d4463a4bd3f06-99b8-427b-85e3-565470ec002f2a7baa7e-a2e9-46ae-95fb-906a002d0184f2b27401-70b8-47d9-8bb8-7978727d4463a4bd3f06-99b8-427b-85e3-565470ec002fc3160ab0-7bf6-41dc-ac40-00c10a1b92e292fa4343-082e-4ae8-a258-09ca8be762f2a4bd3f06-99b8-427b-85e3-565470ec002fc3160ab0-7bf6-41dc-ac40-00c10a1b92e2c90ed09f-cecb-4ca9-a1a3-3a0e40c0ec94b1eb7c44-0702-403a-ae7d-a6058be381c58e36946f-1676-41d5-9242-87b2f3bb46117eddb5ad-0ce9-42fb-9651-b29cc3119ebcaa175c13-954e-40fb-90f6-e7082044b3804f100a23-0c03-4ac7-bf02-6d163e08d8a8ca3d50d0-54ec-46c5-9208-8919ae170aed53a61c2d-d4b9-426d-8758-967727f5833393e71ff6-2d2e-4520-aa77-a2b7ceb621af60cfa21d-5e92-4db5-bedc-482a9e3435600341b0ef-cf46-4902-8dd6-50bca452001e0f7114b5-e447-4599-a8c8-85a99e8fee249a5568fc-59d6-49aa-a08f-26e66ed05a9dfdc1a974-c0ef-4868-a686-6ab133cfa9dbe185c336-82dc-4a51-9e65-5aab48a7ca33e04a9a43-6683-4b7a-9843-231783748906empty:1empty:1Cempty:1empty:2empty:2Cempty:2empty:3empty:3Uempty:3empty:4empty:4Gempty:4empty:5empty:5Cempty:5empty:6empty:6Cempty:6empty:7empty:7Uempty:7empty:8empty:8Gempty:8empty:9empty:9Cempty:9empty:10empty:10Uempty:10empty:11empty:11Gempty:11empty:12empty:12Aempty:12empty:13empty:13Cempty:13empty:14empty:14Aempty:14empty:15empty:15Cempty:15empty:16empty:16Aempty:16m-27empty:17Am-27m-27empty:18Am-27m-27empty:19Cm-27m-27empty:20Cm-27m-27empty:21Cm-27m-27empty:22Gm-27m-27empty:23Um-27m-27empty:24Am-27m-27empty:25Gm-27m-27empty:26Am-27m-27empty:27Um-27m-27empty:28Cm-27m-27empty:29Cm-27m-27empty:30Gm-27m-27empty:31Am-27m-27empty:32Am-27m-27empty:33Cm-27m-27empty:34Um-27m-27empty:35Um-27m-27empty:36Gm-27m-27empty:37Um-27empty:38empty:38Gempty:38empty:39empty:39Gempty:39empty:40empty:40Uempty:40empty:41empty:41Gempty:41empty:42empty:42Aempty:42empty:43empty:43Cempty:43empty:44empty:44Uempty:44empty:45empty:45Gempty:45empty:46empty:46Uempty:46empty:47empty:47Cempty:47empty:48empty:48Cempty:48empty:49empty:49Aempty:49empty:50empty:50Cempty:50empty:51empty:51Aempty:51empty:52empty:52Cempty:52empty:53empty:53Aempty:53empty:54empty:54Aempty:54empty:55empty:55Gempty:55empty:56empty:56Cempty:56empty:57empty:57Uempty:57empty:58empty:58Uempty:58empty:59empty:59Gempty:59empty:60empty:60Uempty:60empty:61empty:61Aempty:61empty:62empty:62Uempty:62empty:63empty:63Cempty:63empty:64empty:64Uempty:64empty:65empty:65Aempty:65empty:66empty:66Uempty:66empty:67empty:67Aempty:67empty:68empty:68Gempty:68empty:69empty:69Gempty:69empty:70empty:70Uempty:70empty:71empty:71Aempty:71empty:72empty:72Uempty:72empty:73empty:73Cempty:73empty:74empty:74Uempty:74empty:75empty:75Gempty:75empty:76empty:76Uempty:76empty:77empty:77Cempty:77empty:78empty:78Uempty:78empty:79empty:79Gempty:79empty:80empty:80Uempty:80empty:81empty:81Gempty:81empty:82empty:82Uempty:82empty:83empty:83Gempty:83empty:84empty:84Gempty:84empty:85empty:85Cempty:85empty:86empty:86Aempty:861020304050607080

Genomic context

GCF_000951615.1_common_carp_genome 29:5,691,351-5,711,4365,692,0005,694,0005,696,0005,698,0005,700,0005,702,0005,704,0005,706,0005,708,0005,710,000ccr-27.1>
Gene legend:
miRCarta_miRNA
This website uses Matomo Analytics and cookies. For more information, please refer to the privacy notice for our websites. Learn moreI agree