Precursor miRBase

ssa-mir-10b-1 (MI0026444)

Accession MI0026444
Name ssa-mir-10b-1
similar to following miRCarta precursors ssa-31852-31851.2
Organism Salmo salar
miRNA ssa-miR-10b-5p
miRNA ssa-miR-10b-3p
Sequence (5' -> 3')
(62 nts)
UACCCUGUAGAACCGAAUUUGUGUUAAUAGAUAACAAUCGCAAGUACGUCUCUACAGGAAUA
MFE -20.10 kcal/mol
first miRBase version 21.0
last miRBase version 21.0
Family mir-10 (MIPF0000033)
Experiments
experiment Pubmed link
Illumina 23865519

Predicted Structure

58b53d24-e5ad-483e-8928-40ef5deee8c2fa7c0d3c-bffd-4382-9c43-b466975a2264fa7c0d3c-bffd-4382-9c43-b466975a2264f92f39cf-d25c-4b03-973c-c4b5fcad876cdd542c69-d411-4343-97e6-a35af9b648dc56383559-5fe3-41b9-a79e-71cc229f6e5af92f39cf-d25c-4b03-973c-c4b5fcad876cdd542c69-d411-4343-97e6-a35af9b648dc4e798376-3b4a-4f9f-99d4-c4cc58ca092f25e088a6-0c80-46de-9771-97be31dc7938dd542c69-d411-4343-97e6-a35af9b648dc4e798376-3b4a-4f9f-99d4-c4cc58ca092f48923ddb-dd53-41fb-a4ff-c6e3ae2561729d21c75c-378d-44bc-b332-c9ec24a033994e798376-3b4a-4f9f-99d4-c4cc58ca092f48923ddb-dd53-41fb-a4ff-c6e3ae256172d4e1d828-c5bf-493c-b461-507c7dbe2b35ecf81cba-60a5-40b0-8f2b-77bead8d4ee448923ddb-dd53-41fb-a4ff-c6e3ae256172d4e1d828-c5bf-493c-b461-507c7dbe2b35d96e75a7-5d21-492a-8c3c-2d53a5bf73498e6e6036-b80d-4bec-ae1d-433ba0aa8f77d4e1d828-c5bf-493c-b461-507c7dbe2b35d96e75a7-5d21-492a-8c3c-2d53a5bf7349bc732c5f-8026-4ff4-867a-5b818d952070b4d4af63-698a-4af8-8155-cdd5e372c710d96e75a7-5d21-492a-8c3c-2d53a5bf7349bc732c5f-8026-4ff4-867a-5b818d95207060bfc280-9054-413a-aab2-147fcee4188a3ebf3f17-a5a8-4bdc-b265-3f69adf55eb3bc732c5f-8026-4ff4-867a-5b818d95207060bfc280-9054-413a-aab2-147fcee4188add655b4e-8b08-4d72-af6d-a6988d8fdffcfd677d95-c32f-4252-b8bb-fc7b1930511e60bfc280-9054-413a-aab2-147fcee4188add655b4e-8b08-4d72-af6d-a6988d8fdffcdd655b4e-8b08-4d72-af6d-a6988d8fdffc684a7013-433c-44e4-952d-3953119404a7684a7013-433c-44e4-952d-3953119404a7a1991573-f489-453f-a9c3-0590b28589fb57bd14d2-cb0d-4f78-b265-3429e25834dd606e49a2-5084-4d7f-8f22-5f0330fd9f78a1991573-f489-453f-a9c3-0590b28589fb57bd14d2-cb0d-4f78-b265-3429e25834dd1b94eb32-2836-415d-b246-e8e19ad2a5ef34902107-4a29-4d48-ad88-f036ea4ccdc357bd14d2-cb0d-4f78-b265-3429e25834dd1b94eb32-2836-415d-b246-e8e19ad2a5ef1b94eb32-2836-415d-b246-e8e19ad2a5ef42724b18-d521-4772-901e-15edbb86710b4041b0b4-5905-4fb1-b09b-43475b28241f1fe8a919-463b-4a23-8369-ee184cab123342724b18-d521-4772-901e-15edbb86710b4041b0b4-5905-4fb1-b09b-43475b28241fc425d4a7-941b-45f5-9f37-5a3a7858531f60ea40f6-e044-45a0-8edc-33a546062cec4041b0b4-5905-4fb1-b09b-43475b28241fc425d4a7-941b-45f5-9f37-5a3a7858531fdabdcc0e-5b71-44b1-b982-fb5bdac422f3cc56fc0d-4da1-47c6-9ff8-6031a9a42279c425d4a7-941b-45f5-9f37-5a3a7858531fdabdcc0e-5b71-44b1-b982-fb5bdac422f3f81757a9-236d-4c67-bf49-0522244f1d61e8eebde5-9c8f-46fa-84bc-50664eaf43e9dabdcc0e-5b71-44b1-b982-fb5bdac422f3f81757a9-236d-4c67-bf49-0522244f1d618e731324-a735-4f74-9d13-980cf91fbc73d6d4e158-f376-4d06-a19c-abecbad4ad73f81757a9-236d-4c67-bf49-0522244f1d618e731324-a735-4f74-9d13-980cf91fbc730d1d921f-a2e8-4828-a442-f7a28a7df8a1bc16e5b0-639c-4021-9efc-d11bed5a55198e731324-a735-4f74-9d13-980cf91fbc730d1d921f-a2e8-4828-a442-f7a28a7df8a19cf5d88c-e2bd-4893-ab2e-4e77ef334acc09a98c49-3eb3-429e-bf05-fd0cc4d7d2e90d1d921f-a2e8-4828-a442-f7a28a7df8a19cf5d88c-e2bd-4893-ab2e-4e77ef334acc9cf5d88c-e2bd-4893-ab2e-4e77ef334acccfbe7ef8-67bd-4b9a-8be1-30bdbd51249dcfbe7ef8-67bd-4b9a-8be1-30bdbd51249dd1ec0baf-9679-4485-bc4c-c75921bb2badd1ec0baf-9679-4485-bc4c-c75921bb2bad65837a02-293a-4345-8f91-baf0a285d7ea65837a02-293a-4345-8f91-baf0a285d7ea52f59f2e-aa85-4b68-8af2-0ebf0175c9ad52f59f2e-aa85-4b68-8af2-0ebf0175c9ad528c58eb-56b7-4272-b47f-d286954c156d528c58eb-56b7-4272-b47f-d286954c156de80a679c-9a24-41f7-a0f5-e18a18d1d0eee80a679c-9a24-41f7-a0f5-e18a18d1d0ee35a9ab31-750f-4083-9520-17be1a4a169e35a9ab31-750f-4083-9520-17be1a4a169e20cb849e-68b8-460f-8f21-c24dbeacaf2120cb849e-68b8-460f-8f21-c24dbeacaf2166d7d6d6-9800-4e1c-9d8b-bf5b297ddb8766d7d6d6-9800-4e1c-9d8b-bf5b297ddb872c606efd-58eb-45ea-a58d-22ebfa35e3032c606efd-58eb-45ea-a58d-22ebfa35e303d7564ea6-3fdb-43de-b83c-2b8b76e071c7d7564ea6-3fdb-43de-b83c-2b8b76e071c71465427b-f084-466c-9c6c-ab3fb3d639bc1465427b-f084-466c-9c6c-ab3fb3d639bcdd8cd6d2-7c91-4d10-abca-9e872681b3fadd8cd6d2-7c91-4d10-abca-9e872681b3fa275618aa-1ac7-4620-8f74-bc06d9e151cc275618aa-1ac7-4620-8f74-bc06d9e151cc2d24e193-9ae9-4393-b3ea-ef23d7a465be09a98c49-3eb3-429e-bf05-fd0cc4d7d2e99cf5d88c-e2bd-4893-ab2e-4e77ef334acc2d24e193-9ae9-4393-b3ea-ef23d7a465be09a98c49-3eb3-429e-bf05-fd0cc4d7d2e9bc16e5b0-639c-4021-9efc-d11bed5a55190d1d921f-a2e8-4828-a442-f7a28a7df8a109a98c49-3eb3-429e-bf05-fd0cc4d7d2e9bc16e5b0-639c-4021-9efc-d11bed5a5519d6d4e158-f376-4d06-a19c-abecbad4ad738e731324-a735-4f74-9d13-980cf91fbc73bc16e5b0-639c-4021-9efc-d11bed5a5519d6d4e158-f376-4d06-a19c-abecbad4ad73e8eebde5-9c8f-46fa-84bc-50664eaf43e9f81757a9-236d-4c67-bf49-0522244f1d61d6d4e158-f376-4d06-a19c-abecbad4ad73e8eebde5-9c8f-46fa-84bc-50664eaf43e9cc56fc0d-4da1-47c6-9ff8-6031a9a42279dabdcc0e-5b71-44b1-b982-fb5bdac422f3e8eebde5-9c8f-46fa-84bc-50664eaf43e9cc56fc0d-4da1-47c6-9ff8-6031a9a4227960ea40f6-e044-45a0-8edc-33a546062cecc425d4a7-941b-45f5-9f37-5a3a7858531fcc56fc0d-4da1-47c6-9ff8-6031a9a4227960ea40f6-e044-45a0-8edc-33a546062cec1fe8a919-463b-4a23-8369-ee184cab12334041b0b4-5905-4fb1-b09b-43475b28241f60ea40f6-e044-45a0-8edc-33a546062cec1fe8a919-463b-4a23-8369-ee184cab12331fe8a919-463b-4a23-8369-ee184cab12338ad0b261-fe62-43a2-8244-6ee170d8bb6934902107-4a29-4d48-ad88-f036ea4ccdc31b94eb32-2836-415d-b246-e8e19ad2a5ef8ad0b261-fe62-43a2-8244-6ee170d8bb6934902107-4a29-4d48-ad88-f036ea4ccdc3606e49a2-5084-4d7f-8f22-5f0330fd9f7857bd14d2-cb0d-4f78-b265-3429e25834dd34902107-4a29-4d48-ad88-f036ea4ccdc3606e49a2-5084-4d7f-8f22-5f0330fd9f78606e49a2-5084-4d7f-8f22-5f0330fd9f7877e8f2c0-743e-4254-8a9e-25a525dc989077e8f2c0-743e-4254-8a9e-25a525dc989082dd8c70-5dca-4e99-98e3-96b765c68293fd677d95-c32f-4252-b8bb-fc7b1930511edd655b4e-8b08-4d72-af6d-a6988d8fdffc82dd8c70-5dca-4e99-98e3-96b765c68293fd677d95-c32f-4252-b8bb-fc7b1930511e3ebf3f17-a5a8-4bdc-b265-3f69adf55eb360bfc280-9054-413a-aab2-147fcee4188afd677d95-c32f-4252-b8bb-fc7b1930511e3ebf3f17-a5a8-4bdc-b265-3f69adf55eb3b4d4af63-698a-4af8-8155-cdd5e372c710bc732c5f-8026-4ff4-867a-5b818d9520703ebf3f17-a5a8-4bdc-b265-3f69adf55eb3b4d4af63-698a-4af8-8155-cdd5e372c7108e6e6036-b80d-4bec-ae1d-433ba0aa8f77d96e75a7-5d21-492a-8c3c-2d53a5bf7349b4d4af63-698a-4af8-8155-cdd5e372c7108e6e6036-b80d-4bec-ae1d-433ba0aa8f77ecf81cba-60a5-40b0-8f2b-77bead8d4ee4d4e1d828-c5bf-493c-b461-507c7dbe2b358e6e6036-b80d-4bec-ae1d-433ba0aa8f77ecf81cba-60a5-40b0-8f2b-77bead8d4ee49d21c75c-378d-44bc-b332-c9ec24a0339948923ddb-dd53-41fb-a4ff-c6e3ae256172ecf81cba-60a5-40b0-8f2b-77bead8d4ee49d21c75c-378d-44bc-b332-c9ec24a0339925e088a6-0c80-46de-9771-97be31dc79384e798376-3b4a-4f9f-99d4-c4cc58ca092f9d21c75c-378d-44bc-b332-c9ec24a0339925e088a6-0c80-46de-9771-97be31dc793856383559-5fe3-41b9-a79e-71cc229f6e5add542c69-d411-4343-97e6-a35af9b648dc25e088a6-0c80-46de-9771-97be31dc793856383559-5fe3-41b9-a79e-71cc229f6e5a56383559-5fe3-41b9-a79e-71cc229f6e5a03a2e0ab-c2f3-43c3-a3f9-2be1766b46e203a2e0ab-c2f3-43c3-a3f9-2be1766b46e2fcb5dbae-e20b-4b8f-81d2-5d39516523c5fcb5dbae-e20b-4b8f-81d2-5d39516523c56a6f505f-76af-41f4-992f-9713db5d51c96a6f505f-76af-41f4-992f-9713db5d51c9e6b83c1f-7fe3-42bc-bd34-a73694ab400460bfc280-9054-413a-aab2-147fcee4188a52942135-24a4-4909-aab3-ba7c61c58b0ef81757a9-236d-4c67-bf49-0522244f1d61e1d50bc8-8409-44aa-9c2e-af4b87b2288935a9ab31-750f-4083-9520-17be1a4a169e8de40394-ce39-4486-b924-05afed02fa19bc16e5b0-639c-4021-9efc-d11bed5a551943849e44-54b7-4619-9a44-2f2dd30df17c82dd8c70-5dca-4e99-98e3-96b765c682938884f037-fe94-4153-a3d2-0247c105c0b8fcb5dbae-e20b-4b8f-81d2-5d39516523c58f32950c-75bc-4bf3-a4a9-a1ace3953354empty:1empty:1Uempty:1empty:2empty:2Aempty:2empty:3empty:3Cempty:3empty:4empty:4Cempty:4empty:5empty:5Cempty:5empty:6empty:6Uempty:6empty:7empty:7Gempty:7empty:8empty:8Uempty:8empty:9empty:9Aempty:9empty:10empty:10Gempty:10empty:11empty:11Aempty:11empty:12empty:12Aempty:12empty:13empty:13Cempty:13empty:14empty:14Cempty:14empty:15empty:15Gempty:15empty:16empty:16Aempty:16empty:17empty:17Aempty:17empty:18empty:18Uempty:18empty:19empty:19Uempty:19empty:20empty:20Uempty:20empty:21empty:21Gempty:21empty:22empty:22Uempty:22empty:23empty:23Gempty:23empty:24empty:24Uempty:24empty:25empty:25Uempty:25empty:26empty:26Aempty:26empty:27empty:27Aempty:27empty:28empty:28Uempty:28empty:29empty:29Aempty:29empty:30empty:30Gempty:30empty:31empty:31Aempty:31empty:32empty:32Uempty:32empty:33empty:33Aempty:33empty:34empty:34Aempty:34empty:35empty:35Cempty:35empty:36empty:36Aempty:36empty:37empty:37Aempty:37empty:38empty:38Uempty:38empty:39empty:39Cempty:39empty:40empty:40Gempty:40empty:41empty:41Cempty:41empty:42empty:42Aempty:42empty:43empty:43Aempty:43empty:44empty:44Gempty:44empty:45empty:45Uempty:45empty:46empty:46Aempty:46empty:47empty:47Cempty:47empty:48empty:48Gempty:48empty:49empty:49Uempty:49empty:50empty:50Cempty:50empty:51empty:51Uempty:51empty:52empty:52Cempty:52empty:53empty:53Uempty:53empty:54empty:54Aempty:54empty:55empty:55Cempty:55empty:56empty:56Aempty:56empty:57empty:57Gempty:57empty:58empty:58Gempty:58empty:59empty:59Aempty:59empty:60empty:60Aempty:60empty:61empty:61Uempty:61empty:62empty:62Aempty:62102030405060

References

Authors Journal Year Pubmed link Title
1 Andreassen et al. BMC Genomics 2013 23865519 Discovery and characterization of miRNA genes in Atlantic salmon (Salmo salar) by use of a deep sequencing approach.
This website uses Matomo Analytics and cookies. For more information, please refer to the privacy notice for our websites. Learn moreI agree